En los Cuartos de final de la Liga Europa de la UEFA 2016-17, participaron los ocho equipos que ganaron en la fase anterior. Estos fueron distribuidos en 4 parejas. Cada pareja se enfrentó en partidos de ida y vuelta de 90 minutos cada uno. En estos encuentros rige la regla del gol de visitante, que determina que el equipo que haya convertido más goles como visitante gana si hay empate en la diferencia de goles. En caso de que no hubiese ganador en el período regular, se disputa una prórroga de 30 minutos, y si no hay ganador se lanzan tiros desde el punto penal.

Celta de Vigo	Anderlecht	Schalke 04	Olympique de Lyon	Manchester United	Beşiktaş	Genk	Ajax
Clasificado	Eliminado	Eliminado	Clasificado	Clasificado	Eliminado	Eliminado	Clasificado

Balaídos Ciudad: Vigo Capacidad: espectadores Club: Celta de Vigo	Constant Vanden Stock Ciudad: Anderlecht Capacidad: espectadores Club: Anderlecht	Veltins-Arena Ciudad: Gelsenkirchen Capacidad: espectadores Club: Schalke 04	Parc Olympique Lyonnais Ciudad: Lyon Capacidad: espectadores Club: Olympique de Lyon

Old Trafford Ciudad: Mánchester Capacidad: espectadores Club: Manchester United	Luminus Arena Ciudad: Genk Capacidad: espectadores Club: Genk	Vodafone Arena Ciudad: Estambul Capacidad: espectadores Club: Beşiktaş	Ámsterdam Arena Ciudad: Ámsterdam Capacidad: espectadores Club: Ajax

	vs.			vs.			vs.			vs.
Anderlecht 2 1 1		Manchester United 3 1 2	Celta de Vigo 4 3 1		Genk 3 2 1	Ajax 4 2 2		Schalke 04 3 0 3	Olympique de Lyon 3 (7) 2 1		Beşiktaş 3 (6) 1 2

Ida; 13 de abril de 2017, 21:05 HEC	Anderlecht	1:1 (0:1)	Manchester United	Constant Vanden Stock, Anderlecht
	Dendoncker  86'	Reporte	37'Mkhitaryan	Árbitro: Felix Brych

Uniformes

Vuelta; 20 de abril de 2017, 21:05 HEC	Manchester United	2:1 (1:1, 1:1) (t. s.)	Anderlecht	Old Trafford, Mánchester
	Mkhitaryan  9' Rashford  106'		32' Hanni	Árbitro: Alberto Undiano Mallenco

Uniformes

Pasa a semifinales Manchester United (Global 2:3)

Ida; 13 de abril de 2017, 21:05 HEC	Celta de Vigo	3:2 (3:1)	Genk	Balaídos, Vigo
	Sisto  15' Aspas  18' Guidetti  38'	Reporte	10' Boëtius  67' Buffel	Árbitro: Clément Turpin

Uniformes

Vuelta; 20 de abril de 2017, 21:05 HEC	Genk	1:1 (0:0)	Celta de Vigo	Luminus Arena, Genk
	Trossard  66'		63' Sisto	Árbitro: William Collum

Uniformes

Pasa a semifinales Celta de Vigo (Global 4:3)

Ida; 13 de abril de 2017, 21:05 HEC	Ajax	2:0 (1:0)	Schalke 04	Ámsterdam Arena, Ámsterdam
	Klaassen 23'  52'	Reporte		Árbitro: Sergei Karasev

Uniformes

Vuelta; 20 de abril de 2017, 21:05 HEC	Schalke 04	3:2 (0:0, 2:0) (t. s.)	Ajax	Veltins-Arena, Gelsenkirchen
	Goretzka  52' Burgstaller  55' Caligiuri  101'		111' Viergever  120' Younes	Árbitro: Ovidiu Haţegan

Uniformes

Pasa a semifinales Ajax (Global 4:3)

Ida; 13 de abril de 2017, 21:05 HEC	Olympique de Lyon	2:1 (0:1)	Beşiktaş	Parc Olympique Lyonnais, Décines-Charpieu
	Tolisso  83' Morel  85'	Reporte	15' Babel	Árbitro: Antonio Mateu Lahoz

Uniformes

Vuelta; 20 de abril de 2017, 21:05 HEC	Beşiktaş	2:1 (1:1, 2:1) (t. s.) (6:7 p.)	Olympique de Lyon	Vodafone Arena, Estambul
	Talisca  27'  58'		32' Lacazette	Árbitro: Milorad Mažić
		Tiros desde el punto penal
	Babel Cenk Tosun Hutchinson Tolgay Arslan Talisca Necip Uylsan Tošić Mitrović		Fekir Tolisso Ghezzal Rybus Valbuena Diakhaby Jallet Gonalons

Uniformes

Pasa a semifinales Olympique de Lyon (Global 3:3 / Gana el Olympique de Lyon 7:6 en los penales)

Manchester United	Celta de Vigo	Ajax	Olympique de Lyon

• Anexo: Cuarta ronda previa de la Liga Europa de la UEFA 2016-17
• Fase de grupos (Grupo A, Grupo B, Grupo C, Grupo D, Grupo E, Grupo F, Grupo G, Grupo H, Grupo I, Grupo J, Grupo K, Grupo L)
• Anexo: Dieciseisavos de final de la Liga Europa de la UEFA 2016-17
• Anexo: Octavos de final de la Liga Europa de la UEFA 2016-17
• Anexo: Semifinales de la Liga Europa de la UEFA 2016-17
• Final de la Liga Europa de la UEFA 2016-17

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