Flydubai opera a los siguientes destinos (en mayo de 2021):[1]
África
Norte de África
África Oriental
Asia
Sudeste Asiático
Sur de Asia
- Afganistán
- Bangladés
- India
- Ahmedabad - Aeropuerto Internacional Sardar Vallabhbhai Patel
- Bombay - Aeropuerto Internacional Chhatrapati Shivaji
- Chennai - Aeropuerto Internacional de Chennai
- Cochín - Aeropuerto Internacional de Cochín
- Delhi - Aeropuerto Internacional Indira Gandhi
- Hyderabad - Aeropuerto Internacional Rajiv Gandhi
- Kozhikode - Aeropuerto Internacional de Kozhikode
- Lucknow - Aeropuerto Internacional Chaudhary Charan Singh
- Maldivas
- Nepal
- Pakistán
- Faisalabad - Aeropuerto Internacional de Faisalabad
- Islamabad - Aeropuerto Internacional de Islamabad
- Karachi - Aeropuerto Internacional Jinnah
- Lahore - Aeropuerto Internacional Allama Iqbal
- Multán - Aeropuerto Internacional de Multán
- Quetta - Aeropuerto Internacional de Quetta
- Sialkot - Aeropuerto Internacional de Sialkot
- Sri Lanka
Asia Central
Oriente Próximo
- Arabia Saudita
- Abha - Aeropuerto Internacional Abha
- Dammam - Aeropuerto Internacional Rey Fahd
- Gassim - Aeropuerto Regional Prince Nayef Bin Abdulaziz
- Hail - Aeropuerto Regional de Hail
- Hofuf - Aeropuerto Internacional Al-Ahsa
- Jizán - Aeropuerto Regional de Jizán
- Mar Rojo - Aeropuerto Internacional de Mar Rojo
- Medina - Aeropuerto Príncipe Mohammad Bin Abdulaziz
- Neom - Aeropuerto de Neom Bay
- Riad - Aeropuerto Internacional Rey Khalid
- Tabuk - Aeropuerto Regional de Tabuk
- Taif - Aeropuerto Regional de Taif
- Yeda - Aeropuerto Internacional Rey Abdulaziz
- Armenia
- Azerbaiján
- Baréin
- Catar
- Emiratos Árabes Unidos
- Dubái
- Aeropuerto Internacional de Dubái Base
- Aeropuerto Internacional de Dubái-Al Maktoum Base Secundaria
- Dubái
- Georgia
- Batumi - Aeropuerto Internacional de Batumi Estacional
- Kutaisi - Aeropuerto de Kopitnari Estacional
- Tiflis - Aeropuerto Internacional de Tiflis
- Irán
- Iraq:
- Israel
- Jordania
- Kuwait
- Líbano
- Omán
Europa
- Albania
- Alemania
- Berlín - Aeropuerto de Berlín-Brandeburgo Willy Brandt (Planes de inicio)
- Austria
- Bielorrusia
- Bosnia y Herzegovina
- Bulgaria
- Croacia
- Dubrovnik - Aeropuerto de Dubrovnik Estacional
- Zagreb - Aeropuerto de Zagreb Estacional
- Eslovaquia
- Finlandia
- Francia
- París - Aeropuerto de París-Orly (Planes de inicio)
- Italia
- Macedonia del Norte
- Malta
- Montenegro
- Tivat - Aeropuerto de Tivat Estacional
- Polonia
- Reino Unido
- Londres - Aeropuerto de Londres-Heathrow (Planes de inicio)
- República Checa
- Rumania
- Rusia
- Cheliábinsk - Aeropuerto de Cheliábinsk (Planes de inicio)
- Ekaterimburgo - Aeropuerto de Ekaterimburgo-Koltsovo
- Grozni - Aeropuerto de Grozni
- Irkutsk - Aeropuerto Internacional de Irkutsk (Planes de inicio)
- Kazán - Aeropuerto Internacional de Kazán Estacional
- Krasnodar - Aeropuerto Internacional de Krasnodar
- Majachkalá - Aeropuerto de Majachkalá-Uytash Estacional
- Mineralnye Vody - Aeropuerto Internacional de Mineralnye Vody Estacional
- Moscú - Aeropuerto Internacional de Moscú-Vnúkovo
- Novosibirsk - Aeropuerto Internacional de Novosibirsk-Tolmachevo
- Perm - Aeropuerto Internacional de Perm-Bolshoye Sávino
- Rostov del Don - Aeropuerto Internacional de Platov Estacional
- Samara - Aeropuerto Internacional de Samara-Kurúmoch Estacional
- Sochi - Aeropuerto Internacional de Sochi
- San Petersburgo - Aeropuerto Internacional Púlkovo (Planes de inicio)
- Serbia
- Turquía
- Ankara - Aeropuerto Internacional Esenboğa
- Esmirna - Aeropuerto de Esmirna-Adnan Menderes Estacional
- Estambul – Aeropuerto de Estambul
- Trebisonda - Aeropuerto de Trebisonda Estacional
- Ucrania
Oceanía
- Australia
- Brisbane - Aeropuerto de Brisbane (Planes de inicio)
- Melbourne - Aeropuerto Internacional Tullamarine (Planes de inicio)
- Sídney - Aeropuerto Internacional Kingsford Smith (Planes de inicio)
Destinos Finalizados
África
Asia
- Afganistán
- Arabia Saudita
- Bangladés
- Catar
- India
- Irán
- Jordania
- Kirguistán
- Sri Lanka
- Tailandia
- Siria
- Yemen
Europa
- Grecia
- Hungría
- Moldavia
- Montenegro
- Rusia
- Moscú - Aeropuerto Internacional de Moscú-Sheremétievo
- Nizhni Nóvgorod - Aeropuerto Internacional de Nizhni Nóvgorod-Strigino
- Rostov del Don - Aeropuerto de Rostov del Don
- Ufá - Aeropuerto Internacional de Ufá
- Volgogrado - Aeropuerto Internacional de Volgogrado
- Vorónezh - Aeropuerto de Vorónezh-Chertovitskoye
- Ucrania