Con los Dieciseisavos de final de la Copa Argentina 1969 dio comienzo el campeonato. Fueron disputados por los 32 equipos participantes: 19 equipos de la Primera División, es decir, los que jugaron el Campeonato Metropolitano 1969 a excepción de Estudiantes de La Plata, River Plate y Vélez Sarsfield; 13 equipos provenientes de las ligas regionales; y Almagro, invitado de la Primera B. Se disputó en varias sedes del país, siendo las más representativas Santa Fe, Rosario, Córdoba, Mendoza, Jujuy, San Juan y Buenos Aires. En esta última se jugaron ambas finales, en el viejo estadio de San Lorenzo.
Los 32 equipos se emparejaron formando una ronda de Dieciseisavos. El sistema fue eliminatorio, a dos rondas (encuentros de ida y vuelta). Los ganadores clasificaron a los 8.avos de final.
Equipos participantes
Primera División
Primera B
 Almagro
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Ligas regionales del interior
 All Boys (SR)
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 Altos Hornos Zapla
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 Américo Tesorieri
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 Atlético Tucumán
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 Central Norte
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 Godoy Cruz
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 Guaraní Antonio Franco
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 Lipton
|
 Los Andes (SJ)
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 Sportivo Belgrano
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Sporting (Punta Alta)
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 Sarmiento (SdE)
|
Distribución geográfica de los equipos
| Región | Cant. | Equipos |
|---|---|---|
| Conurbano bonaerense |
10 | Almagro, Banfield, Chacarita Juniors, Deportivo Morón, Independiente, Lanús, Los Andes, Platense, Quilmes y Racing Club |
 Ciudad de Buenos Aires |
5 | Argentinos Juniors, Atlanta, Boca Juniors, Huracán y San Lorenzo |
 Provincia de Santa Fe |
2 | Colón y Unión |
 Ciudad de Rosario |
2 | Newell's Old Boys y Rosario Central |
| Interior de la provincia de Buenos Aires |
1 | Sporting (Punta Alta) |
| Ciudad de La Plata |
1 | Gimnasia y Esgrima |
| Provincia de Córdoba |
1 | Sportivo Belgrano |
| Provincia de Corrientes |
1 | Lipton |
| Provincia de Jujuy |
1 | Altos Hornos Zapla |
| Provincia de La Pampa |
1 | All Boys |
| Provincia de La Rioja |
1 | Américo Tesorieri |
| Provincia de Mendoza |
1 | Godoy Cruz |
| Provincia de Misiones |
1 | Guaraní Antonio Franco |
| Provincia de Salta |
1 | Central Norte |
| Provincia de San Juan |
1 | Los Andes |
| Provincia de Santiago del Estero |
1 | Sarmiento |
| Provincia de Tucumán |
1 | Atlético Tucumán |
Partidos
| 6 de febrero de 1969 | Central Norte |
1:0
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Atlanta | El Gigante del Norte, Salta | |
Palavecino 
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| 9 de febrero de 1969 | Central Norte |
0:3
|
Atlanta | El Gigante del Norte, Salta | |
| R. Juárez Zerrillo C. De La Iglesia
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| 6 de febrero de 1969 | Altos Hornos Zapla |
2:2
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Almagro | Emilio Fabrizzi, San Salvador de Jujuy | |
| Martínez Lazarte
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Machao Fuentes
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||||
| 9 de febrero de 1969 | Altos Hornos Zapla |
1:0
|
Almagro | La Tablada, San Salvador de Jujuy | |
| Pedernera
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|||||
| 6 de febrero de 1969 | Américo Tesorieri |
0:5
|
San Lorenzo | Carlos Mercado Luna, La Rioja | |
| Doval Veira Ayala
|
|||||
| 8 de febrero de 1969 | Américo Tesorieri |
0:3
|
San Lorenzo | Carlos Mercado Luna, La Rioja | |
| Doval Ayala
|
|||||
| 8 de febrero de 1969 | Sportivo Belgrano |
0:1
|
Argentinos Juniors | Óscar Carlos Boero, San Francisco | |
| Medero
|
|||||
| 9 de febrero de 1969 | Sportivo Belgrano |
1:1
|
Argentinos Juniors | Óscar Carlos Boero, San Francisco | |
| Panero
|
Di Benedetto
|
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| 6 de febrero de 1969 | Lipton |
1:4
|
Lanús | Quincho D'Andrea, Corrientes | |
| Maidana
|
Á. Silva Daniel Quevedo Vicente
|
||||
| 8 de febrero de 1969 | Lipton |
3:5
|
Lanús | Quincho D'Andrea, Corrientes | |
| Esquivel Encinas Benítez
|
Daniel Quevedo Á. Silva B. Acosta
|
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| 6 de febrero de 1969 | Guaraní Antonio Franco |
2:0
|
Gimnasia y Esgrima (LP) | Clemente Argentino Fernández de Oliveira, Posadas | |
| Benítez Medina
|
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| 9 de febrero de 1969 | Guaraní Antonio Franco |
4:4
|
Gimnasia y Esgrima (LP) | Clemente Argentino Fernández de Oliveira, Posadas | |
| De France Lecano Núñez (p)
|
Pignani Onnis (1 p)
|
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| 5 de febrero de 1969 | Rosario Central |
3:2
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Quilmes | Dr. Lisandro de la Torre, Rosario | |
| Griguol Castronovo Gramajo
|
Bertolotti (p) Leeb
|
||||
| 7 de febrero de 1969 | Rosario Central |
4:0
|
Quilmes | Dr. Lisandro de la Torre, Rosario | |
| Gramajo Poncini Castronovo
|
|||||
| 6 de febrero de 1969 | Newell's Old Boys |
0:1
|
Banfield | El Coloso del Parque, Rosario | |
| O. Cáceres
|
|||||
| 9 de febrero de 1969 | Newell's Old Boys |
3:1
|
Banfield | El Coloso del Parque, Rosario | |
| J. C. Montes
|
Bulla
|
||||
| 5 de febrero de 1969 | Colón |
1:1
|
Deportivo Morón | Brigadier General Estanislao López, Santa Fe | |
| Colman
|
Ricci
|
||||
| 8 de febrero de 1969 | Colón |
3:2
|
Deportivo Morón | Brigadier General Estanislao López, Santa Fe | |
| Borgogno Balbuena Colman
|
J. C. González C. Pagano |
||||
| 6 de febrero de 1969 | Unión |
2:4
|
Independiente | 15 de Abril, Santa Fe | |
| Mendoza D. Benítez
|
Pastoriza Bernao
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| 9 de febrero de 1969 | Unión |
1:1
|
Independiente | 15 de Abril, Santa Fe | |
| Vitale
|
Tarabini
|
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| 6 de febrero de 1969 | Sporting (Punta Alta) |
1:2
|
Huracán | Enrique Mendizabal, Punta Alta | |
| Cicchini
|
Vera Díaz Chazarreta
|
||||
| 8 de febrero de 1969 | Sporting (Punta Alta) |
1:1
|
Huracán | Roberto Natalio Carminatti, Bahía Blanca | |
| Oberti
|
Brindisi
|
||||
| 6 de febrero de 1969 | All Boys |
0:1
|
Platense | Dr. Ramón Turnes, Santa Rosa | |
| Subiat
|
|||||
| 10 de febrero de 1969 | All Boys |
0:1
|
Platense | Dr. Ramón Turnes, Santa Rosa | |
| J. Gatti
|
|||||
| 6 de febrero de 1969 | Atlético Tucumán |
2:3
|
Boca Juniors | Monumental José Fierro, San Miguel de Tucumán | |
| Campi Cuello
|
Morales (a.g.) Coch Nicolau
|
||||
| 9 de febrero de 1969 | Atlético Tucumán |
0:0
|
Boca Juniors | Monumental José Fierro, San Miguel de Tucumán |
| 6 de febrero de 1969 | Sarmiento (SdE) |
2:0
|
Los Andes | Sarmiento, La Banda | |
| Bellido Luna
|
|||||
| 10 de febrero de 1969 | Sarmiento (SdE) |
0:1
|
Los Andes | Sarmiento, La Banda | |
| Silva
|
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| 7 de febrero de 1969 | Godoy Cruz |
1:3
|
Chacarita Juniors | Feliciano Gambarte, Mendoza | |
| J. Núñez
|
Recúpero Poncio Á. Marcos
|
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| 10 de febrero de 1969 | Godoy Cruz |
2:3
|
Chacarita Juniors | Feliciano Gambarte, Mendoza | |
| Santilli Albarracín
|
Puntorero H. Neumann O. Amarilla |
||||
| 6 de febrero de 1969 | Los Andes (SJ) |
1:2
|
Racing Club | ||
| J. González
|
J. C. Cárdenas Raffo
|
||||
| 10 de febrero de 1969 | Los Andes (SJ) |
1:1
|
Racing Club | Parque de Mayo, San Juan | |
| J. González
|
J. C. Cárdenas
|
||||