Monkey, los Amigos Justicieros y demás superhéroes se enfrentan a un extraterrestre enmascaradado apodado «El Gran Tonina».

Cuando el verano termina, Dexter regresa a la escuela y se encuentra con un nuevo estudiante llamado Mandark/Cerebro (su principal archienemigo), y este le roba el trono del más inteligente y le obliga a desconectar su laboratorio, pero el amor de Cerebro por Dee Dee termina siendo su perdición.

El cumpleaños de Monkey es interrumpido por dos alienígenas que planean devorar los planetas del sistema solar como una brocheta, y este decide atacarlos, pero por ser su cumpleaños sus amigos y compañeros se lo impiden.

Dee-Dee le roba a Dexter su última creación, un control remoto que permite cambiar de apariencia a quien lo desee, convirtiéndolo en animal.

Dexter logra revivir un dinosaurio usando el cerebro y corazón de un perro, pero Dee Dee probablemente lo adopta como su mascota.

Dexter se adentra curiosamente en las profundidades de la habitación de Dee Dee.

Monkey se encuentra con un terrible miembro de la galaxia llamado Huntor, quien dice ser el mejor cazador del universo y lo desafía a ser atrapado en la selva, teniendo a sus amigos de rehenes.

Dexter y Dee Dee compiten para ser el nuevo compañero del Mayor América.

En un día como cualquiera, los Amigos Justicieros pelean por el control del televisor.

El Amo de la Computadora, un viejo y maligno videojuego empieza a invadir el laboratorio de Dexter.

Dexter se enamora de Lisa, su niñera adolescente, pero el único obstáculo para conquistarla resulta ser su novio Jeff.

Para saber por qué Dee Dee no lo está molestando, Dexter decide espiarla reduciendo su tamaño con el laboratorio portátil y se ve involucrado en un drama amoroso con una muñeca llamada Darbie, quien se convierte en su esposa.

Durante una batalla junto a sus amigos, Gigantón se enamora de una gigantesca villana apodada «La Cosa», quien posee sus mismas características físicas.

Los Amigos Justicieros se preparan para la inesperada llegada del Tío Sam, el estricto pariente del Mayor América.

Los Amigos Justicieros conocen a Ratman, un extraño héroe que vive en las alcantarillas para compensar la fuga de agua.

Dexter se siente amenazado por su archirrival, Cerebro, quien lo obliga a desconectar su laboratorio secreto.

Cerebro planea vengarse de Dexter en la feria científica.

Luego de ser adoptado como mascota por Val Hallen, Tigre Blanco se queda a pasar una noche en el apartamento de los Amigos Justicieros, sin imaginar que el Mayor América es alérgico a los felinos.

Con el propósito de ser más varonil, Dexter usa su invento para hacer crecer su barba y unirse a su ídolo favorito, Action Hank.

Dexter intercambia su cuerpo con un ratón y es perseguido incansablemente por su madre confundiéndolo con el nombre de Jerry.

Dexter, Dee Dee y sus padres visitan la pizzería de Chubby, pero los empleados intentan apoderarse de los inventos de Dexter.

Dexter modifica su ADN para que le gusten los vegetales, pero algo sale mal y esto se convierte en una alocada adicción para él.

Cuando Dee Dee está enferma, Dexter, por obligación de su madre, acude a su habitación y le cuenta una historia.

Con el propósito de estudiar el resfriado de Dee Dee, reduciendo su tamaño y usando la unidad de exploración atómica, Dexter entra por accidente a las profundidades del cuerpo del perro.

Dexter intenta conseguir un disquete dorado para asistir a la montaña del Profesor Hock, en donde se ocultan sus mejores inventos científicos.

Dexter y Dee Dee empiezan a competir en una carrera de autos, pero Cerebro los interrumpe y arruina sus planes.

Dexter cree que es uno de los grandes días para la ciencia en que todo sale mal.

Dexter intenta alcanzar a Dee Dee con su nueva bicicleta en la calle.

Mientras sus padres disfrutan un día en la playa, Dexter decide comunicarse con las ballenas y delfines a través de música y expedición submarina, pero sus planes son interrumpidos cuando Dee Dee es raptada por unos piratas.

Cuando Gigantón se queda dormido, sueña con se encuentra con Clem y Mitch, sus marionetas de televisión favoritas.

En un día de campamento familiar, Dexter se adentra en la búsqueda del legendario y extraordinario «Pie Grande», pero Dee Dee se hace su amiga llamándolo con el apodo de «Sassy» y empieza a seguirlo a todas partes.

Cuando Dee Dee toma fotos de todos los inventos de Dexter, este se infiltra en una base secreta para recuperar el rollo y evitar que su laboratorio sea descubierto.

Dexter y sus amigos asisten erróneamente a una convención de muñecas.

Tras ser alcanzada por un rayo experimental de Dexter, su madre se convierte en una superheroína para salvar a la humanidad.

Dexter construye un robot llamado Ultra-Tonto 2000, para que sea su asistente, pero este adquiere algún pensamiento propio y se adueña del laboratorio.

Cuando Dexter no soporta más oír cantar a Dee Dee en su habitación al realizar un experimento, decide cambiarle la voz, pero Dee Dee intenta aprobar convirtiéndose en el barítono para el coro escolar.

Debido a las alteraciones de su madre, Dexter y Dee Dee se ven obligados a alejar a su padre de los panqués, pero este con una actitud psicótica, se dispone a hacer cualquier cosa para apoderarse de ellos.

Una villana coleccionista de pieles de simio llamada Pieltra, desea la piel de Monkey para completar su colección de tapados.

Dee Dee, Lee Lee y Mee Mee empiezan a combatir el crimen en la ciudad.

Durante el cumpleaños de Dee Dee, Dexter es mordido por un extraño payaso. A causa de esto, no para de reír y por las noches se convierte en un payaso de verdad que hace muchas locuras y bromas pesadas a la gente de la ciudad.

En el camino de regreso a su casa, un molesto perro sigue a Dexter hasta el laboratorio y con el fin de comunicarse con este, mediante el uso de la ciencia, consigue hacer que el perro hable el idioma humano.

Dexter conoce al supuesto primer científico más extraordinario del mundo, un cavernícola que descubrió el fuego desde hace 485.000 años.

A raíz de inspirarse por las historietas del Mayor América, Dexter se las ingenia para probar todo tipo de superpoderes.

Todas las cosas empiezan a frustrarse cuando el Padre de Dexter y Dee Dee desea mirar el juego de golf más importante del año, pero ambos junto a su madre se encargan de interrumpirlo todo el tiempo.

Cuando un foco viejo del laboratorio se descompone, Dexter emprende un dramático recorrido por el supermercado junto a su madre, con el objetivo de comprar uno nuevo.

Dexter pone a prueba un cinturón para hacer todo lo que hace al revés, pero las cosas no salen bien cuando Dee Dee se adueña del interruptor direccional.

Cerebro intenta impresionar a Dee Dee en el campeonato mundial de Surf en la playa.

Dee Dee recibe competencia para el recital de ballet con una pequeña niña conocida como Lalavava, la hermana de Cerebro.

Dexter y Dee Dee empiezan a competir en varios videojuegos en su laboratorio.

Dexter y la Computadora empiezan a frustrar los planes de Cerebro.

Dexter intenta salvar la vida de Dynomutt (Dinamita), el Perro Maravilla, el compañero de Blue Falcon (El Halcón Azul), y junto a ellos enfrentar las acciones delictivas en la ciudad.

El episodio es una re-narración de cómo el laboratorio de Dexter llegó a ser en forma de una ópera sobre la historia de los primeros años de Dexter.

Dexter forma parte de un intercambio estudiantil y es enviado a Japón.

Dexter intenta ser feliz creando un «removedor de rudeza de hermanas» para que Dee Dee deje de ser tan molesta, todo acaba en una discusión con Dee Dee muy fuerte y ambos acaban dentro del removedor de rudeza causando dos versiones rudas de ambos, quedando ellos muy educados y amables. Pero sus contrapartes causan muchos problemas fuertes logrando que la madre de Dexter se enfurezca de una manera violenta como nunca antes se la había visto. Los Dexter y Dee Dee malvados comienzan a destruir el laboratorio de Dexter, mientras que los Dexter y Dee Dee educados son incapaces de acudir a la fuerza bruta como antes, entonces hacen creer a los malvados que si entran en la máquina, habrá más como ellos, pero Dexter educado pone «invertir removicion» a su máquina y los educados y los groseros se mezclan formando una vez más a los Dexter y Dee Dee normales, quienes discuten sobre quien tuvo la culpa en primer lugar. Todo vuelve a la normalidad, pero su madre está esperando a ambos en su habitación para lavarles la boca con jabón. Al final Dexter dice algo que se oye como «M****a» (J*****a).

Monkey de nuevo se enfrenta a Quack en el laboratorio de Dexter.

Una inesperada historia se trata de los primeros años de Cerebro, pero sus padres lo llamaban con el nombre de «Susan».

Dexter y Cerebro se encuentran atrapados en la computadora del laboratorio debido a que está infectada de virus.

Dexter y Dee Dee empiezan a construir su propio laboratorio secreto, pero las cosas se complican al colocar pavimentos, paredes y focos en azul y rosa.

Dexter protagoniza su propia historieta de superhéroes, convirtiérdose en «Súper Dexter, El Súper Ser de la Ciencia" y lucha contra su archi-enemiga, Deestructa.

Dexter reemplaza a su antiguo y primer robot, el Robo-Dexo 2000 con uno nuevo más avanzado y poderoso, el Robo-Dexo 3000.

Cuando Dexter necesita aprobar al menos alguna prueba en las clases de Educación Física, Dee Dee decide convertirse en su entrenadora.

Dee Dee logra engañar a Dexter mientras su laboratorio está sin electricidad.

El Padre de Dexter intenta solucionar un problema de televisión con la ayuda de Dexter.

Dexter se queda a cargo de la biblioteca escolar en una hora, pero al final ocurre un desorden.

Luego de ayudar con los trabajos temporales en el laboratorio secreto, Dexter y Dee Dee se unen a un dúo superheróico.

Dexter se convierte en un guerrero apodado «El bárbaro» para luchar contra monstruos.

Los Padres de Dexter y de Cerebro, Dee Dee y Koosalagoopagoop, los Amigos Justicieros, Monkey y la Agente Honeydew, compiten en una carrera de autos.

Dexter tiene «fiebre de pollo» y no para de rascarse hasta que finalmente se convierte en una malévola gallina contaminada que empieza a asustar a Dee Dee.