La siguiente es una lista de las universidades y otras instituciones de educación superior en Macedonia del Norte. La lista está ordenada según los tipos de universidades, públicas —de financiación estatal— y privadas.
Instituciones públicas
- Universidad San Cirilo y San Metodio de Skopie
- Universidad San Clemente de Ohrid de Bitola
- Universidad Goce Delčev de Štip
- Universidad de Ciencias de la Información y Tecnología San Pablo Apóstol de Ohrid
- Universidad Estatal de Tetovo
Instituciones privadas
- BAS - Business Academy Smilevski - Skopje
- Universidad Internacional de los Balcanes
- Euro College Kumanovo
- South East European University
- International University Of Struga
- FON University
- University American College Skopje
- University of Tourism and Management in Skopje
- Euro-Balkan University
- European University-Republic of Macedonia
- University of Studies Struga "EuroCollege"
- MIT Faculties
- New York University Skopje
- University for Audiovisual Arts - Parisian European Film Academy ESRA - Skopje
- International Summer University
- BAS - Business Academy Smilevski - Skopje