El torneo se jugó en dos etapas, una Etapa Clasificatoria y una Etapa Eliminatoria, en la Primera Fase los 196 equipos participantes se dividieron en 50 zonas de 3 equipos, y 46 de 4 dependiendo de su cercanía geográfica; donde se enfrentaron entre ellos a partidos de ida y vuelta. Clasificaron a la Segunda Fase los primeros y segundos de cada grupo de cuatro equipos y los primeros de los grupos de tres equipos.
La Etapa Eliminatoria estuvo dividida en 3 grupos de 32 equipos cada uno, en cada una hubo series eliminatorias a doble partido empezando por la Segunda Fase hasta la Quinta Fase donde se decidieron 3 campeones en simultáneo. Los 3 campeones ascendieron de manera directa mientras que los subcampeones disputaron promociones contra equipos provenientes del Torneo Argentino B 2005/06 para poder ascender.