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El nombre boquerón puede referirse a varias especies de pez:^[1]​

• En todo el mundo se llama así a las siguientes especies de la familia engráulidos:
  • Engraulis encrasicolus - Boquerón
  • Engraulis japonicus - Boquerón
  • Encrasicholina heteroloba - Boquerón aduanero
  • Stolephorus commersonnii - Boquerón bombra
  • Encrasicholina punctifer - Boquerón bucanero
  • Encrasicholina devisi - Boquerón de DeVis
  • Stolephorus waitei - Boquerón de manchas
  • Stolephorus indicus - Boquerón indio

• En Cuba y Puerto Rico, además, también se llama boquerón a dos especies de la familia carángidos:
  • Seriola fasciata - Boquerón
  • Seriola rivoliana - Boquerón