Las instituciones autónomas de Costa Rica son instituciones que gozan de algún grado de autonomía en aspectos organizativos, económicos, administrativos u otras, con respecto al Poder Ejecutivo. La mayor cantidad de estas fueron fundadas o convertidas en tales durante el periodo de la Junta de Gobierno tras la Guerra Civil de 1948, especialmente durante los gobiernos del Partido Liberación Nacional en su época desarrollista socialdemócrata.

La Asamblea Legislativa ofrece la lista de instituciones autónomas del país y un enlace a su sitio web aquí.