XXXV Copa de la UEFA Países Bajos Países Bajos 2005-2006
Sede	Eindhoven
Fecha	12 de julio de 2005 10 de mayo de 2006
Cantidad de equipos	144 participantes
Podio • Campeón • Subcampeón • Semifinalistas	Sevilla (1° título) Middlesbrough Schalke 04 Steaua de Bucarest
Goleador	Matias Delgado (BAS) (7 goles)

La Copa de la UEFA 2005-06 fue la 35.ª edición de la competición se disputó entre el 12 de julio de 2005 y finalizaría el 10 de mayo de 2006, dando un total de 144 participantes de 51 federaciones nacionales afiliadas a la UEFA de los cuales 96 equipos jugarían las fases preliminares previa a la fase de grupos, el campeón defensor de la edición anterior el CSKA Moscú quedaría eliminado en la fase de grupos.

En esta edición el Sevilla F. C. de España se coronó campeón por primera vez, en la que sería la 1.ª de sus 7 consagraciones, tras derrotar en la final al Middlesbrough por marcador de 4-0 en el estadio Philips Stadion de la ciudad de Eindhoven. Por ello, jugaría la Supercopa de Europa 2006 contra el campeón de la Liga de Campeones de la UEFA 2005-06

Equipo local ida	Resultado	Equipo visitante ida	Ida	Vuelta
FK Bashkimi	4:1	NK Žepče	3:0[1]​	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Birkirkara	0:6	APOEL Nicosia	0:4 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
KS Teuta	3:4	NK Široki Brijeg	3:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
AC Omonia	6:0	Hibernians	3:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	3:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
UE Sant Julià	0:10	Rapid Bucarest	0:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
KS Elbasani	1:1 (v.)	FK Vardar	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
SP Domagnano	0:8	NK Domžale	0:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

Equipo local ida	Resultado	Equipo visitante ida	Ida	Vuelta
FK Baku	2:3	MŠK Žilina	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Ferencváros	2:3	FC MTZ-RIPO	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Banants	4:3	Lokomotivi Tbilisi	2:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Torpedo Kutaisi	0:6	BATE Borisov	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Nistru Otaci	5:2	FK Khazar Lenkoran	3:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
1. FSV Maguncia 05	4:0	FC MIKA	4:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Vaduz	2:1	FC Dacia Chişinău	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

Equipo local ida	Resultado	Equipo visitante ida	Ida	Vuelta
FK Ekranas	1:2	Cork City	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Longford Town	3:5	Carmarthen Town AFC	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Rhyl	(v.) 4:4	FK Atlantas	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Portadown	1:3	Viking FK	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
AC Allianssi	4:1	CS Pétange	3:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Linfield	(v.) 2:2	FK Ventspils	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
NSÍ Runavík	0:6	FK Liepājas Metalurgs	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC TVMK Tallinn	1:3	MyPa	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Esbjerg fB	7:2	FC Flora Tallinn	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	6:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
ÍBV Vestmannaeyjar	2:3	B36 Tórshavn	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Etzella Ettelbruck	0:6	Keflavík ÍF	0:4 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

Equipo local ida	Resultado	Equipo visitante ida	Ida	Vuelta
FK Bashkimi	0:11	Maccabi Petah-Tikvah	0:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:6 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
APOEL Nicosia	3:2	Maccabi Tel-Aviv	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	(pró.) 2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Litex Lovech	(v.) 2:2	NK Rijeka	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
NK Inter Zaprešić	1:7	Estrella Roja de Belgrado	1:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:4 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FK Zeta	2:5	NK Široki Brijeg	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:4 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
NK Publikum	1:3	Levski Sofia	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Dinamo Bucarest	4:3	AC Omonia	3:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Rapid Bucarest	4:1	FK Vardar	3:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Ashdod	3:3 (v.)	NK Domžale	2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Vaduz	1:6	Beşiktaş	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
OFK Belgrado	2:2 (v.)	Lokomotiv Plovdiv	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

Equipo local ida	Resultado	Equipo visitante ida	Ida	Vuelta
MŠK Žilina	3:4	Austria Viena	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Legia Warszawa	1:5	FC Zürich	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:4 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC MTZ-RIPO	2:3	FK Teplice	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Dyskobolia Grodzisk	4:1	FK Dukla Banská Bystrica	4:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Grasshopper	(v.) 3:3	Wisła Płock	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Banants	2:8	Dnipro Dnipropetrovsk	2:4 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:4 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Krylia Sovetov	4:0	BATE Borisov	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Nistru Otaci	0:3	Grazer AK	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Sopron	1:5	Metalurg Donetsk	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
SV Pasching	3:3 (v.)	Zenit San Petersburgo	2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

Equipo local ida	Resultado	Equipo visitante ida	Ida	Vuelta
Djurgårdens IF	1:1 (v.)	Cork City	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 Archivado el 26 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Copenhague	4:0	Carmarthen Town AFC	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Rhyl	1:3	Viking FK	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
SK Brann	2:0	AC Allianssi	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Halmstads BK	5:3	Linfield	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	4:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FK Liepājas Metalurgs	2:6	Racing Genk	2:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
MyPa	(v.) 2:2	Dundee United	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Esbjerg fB	1:1 (2-3 p.)	Tromsø IL	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Midtjylland	4:3	B36 Tórshavn	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
1. FSV Maguncia 05	4:0	Keflavík ÍF	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

La primera ronda de la competición consistió en emparejamientos a doble partido entre los 80 equipos clasificados finalmente. 30 de ellos lo habían conseguido directamente, 31 lo consiguieron en las fases de clasificación previas, otros 3 se clasificaron por medio de la Copa Intertoto, y a todos estos se unieron los 16 equipos que no consiguieron acceder a la Liga de Campeones de la UEFA en su última ronda de clasificación.

Según el sorteo, se formaron 40 emparejamientos con cabezas de serie y la restricción de no jugar equipos del mismo país entre sí. La eliminatoria consistió en dos partidos de ida y vuelta, disputados el 15 y el 29 de septiembre, respectivamente.

Equipo local ida	Resultado	Equipo visitante ida	Ida	Vuelta
Slavia Praga	4:1	Cork City FC	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Bayer Leverkusen	0:2	PFC CSKA Sofia	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Hamburgo SV	2:1	FC Copenhague	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Viking FK	(v)2:2	FK Austria Viena	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
AS Monaco	5:1	Willem II Tilburg	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	3:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Brøndby IF	3:2	FC Zürich	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Maccabi Petah-Tikvah	5:4	Partizan Belgrado	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	5:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
US Palermo	6:1	Anorthosis Famagusta FC	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	4:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
SK Brann	3:5	Lokomotiv Moscú	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FK Teplice	1:3	RCD Espanyol	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Vitória Setúbal	1:2	UC Sampdoria	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Vålerenga IF	1:6	Steaua Bucarest	0:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
RC Lens	5:3	Dyskobolia Grodzisk	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	4:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Halmstads BK	(v)4:4	Sporting de Portugal	1:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	(pr)3:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
APOEL Nicosia	1:4	Hertha BSC Berlin	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Litex Lovech	3:2	Racing Genk	2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Grasshopper-Club Zürich	4:1	MyPa	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	3:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Middlesbrough FC	2:0	Skoda Xanthi FC	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Hibernian FC	1:5	FC Dnipro Dnipropetrovsk	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
PFC Krylia Sovetov	6:6(v)	AZ Alkmaar	5:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:3 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Estrella Roja de Belgrado	(v)1:1	SC Braga	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Basel	6:0	NK Široki Brijeg	5:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Grazer AK	0:7	RC Estrasburgo	0:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Tromsø IL	2:1	Galatasaray SK	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
AS Roma	5:1	Aris Salónica FC	5:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
AJ Auxerre	2:2(v)	Levski Sofia	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Dinamo Bucarest	5-2	Everton FC	5:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Baník Ostrava	2:5	SC Heerenveen	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:5 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
CSKA Moscú	6:2	FC Midtjylland	3:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	3:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
KFC Germinal Beerschot	0:0(1-4 p)	Olympique Marsella	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Feyenoord de Róterdam	1:2	Rapid Bucarest	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Stade Rennais FC	3:1	CA Osasuna	3:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
VfB Stuttgart	2:1	NK Domžale	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
FC Shakhtar Donetsk	6:1	Debreceni VSC	4:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
PAOK Salónica FC	(v)3:3	Metalurg Donetsk	1:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:2 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Sevilla FC	2:0	1. FSV Maguncia 05	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Beşiktaş JK	4:2	Malmö FF	0:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	4:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Bolton Wanderers FC	4:2	Lokomotiv Plovdiv	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	2:1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Zenit San Petersburgo	1:0	AEK Atenas FC	0:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Vitória Guimarães	4:0	Wisła Cracovia	3:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).	1:0 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).

En el sorteo se repartieron los equipos en ocho grupos de cinco integrantes. Accedieron a la siguiente ronda los tres primeros clasificados.

La liguilla de cada grupo constó de una sola vuelta, de tal manera que cada equipo disputase entre sus cuatro rivales dos partidos como local y dos como visitante. Un programa informático se encargó de asignar la localía de cada encuentro, procurando que no se disputen partidos en los países del norte en el mes de diciembre.

Esta fase fue disputada entre el 20 de octubre y el 15 de diciembre de 2005.

Leyenda:

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Mónaco	9	4	3	0	1	6	2	+4
Hamburgo	9	4	3	0	1	5	2	+3
Slavia Praga	4	4	1	1	2	6	8	-2
Viking	4	4	1	1	2	3	6	-3
CSKA Sofía	3	4	1	0	3	5	7	-2

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Palermo	8	4	2	2	0	6	2	+4
Espanyol	8	4	2	2	0	4	2	+2
Lokomotiv Moscú	7	4	2	1	1	8	3	+5
Brøndby IF	4	4	1	1	2	5	8	-3
Maccabi Petah-Tikvah	0	4	0	0	4	1	9	-8

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Steaua Bucarest	8	4	2	2	0	7	0	+7
Lens	7	4	2	1	1	7	5	+2
Hertha Berlín	6	4	1	3	0	1	0	+1
Sampdoria	5	4	1	2	1	4	3	+1
Halmstads BK	0	4	0	0	4	1	12	-11

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Middlesbrough	10	4	3	1	0	6	0	+6
AZ Alkmaar	10	4	3	1	0	5	1	+4
Litex Lovech	6	4	2	0	2	4	5	-1
Dnipro Dnipropetrovsk	3	4	1	0	3	4	9	-5
Grasshopper	0	4	0	0	4	3	7	-4

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Racing Estrasburgo	8	4	2	2	0	7	3	+4
Roma	7	4	2	1	1	7	6	+1
Basel	6	4	2	0	2	7	9	-2
Estrella Roja	4	4	1	1	2	7	8	-1
Tromsø IL	3	4	1	0	3	7	9	-2

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Olympique de Marsella	9	4	3	0	1	5	3	+2
Levski Sofia	6	4	2	0	2	4	4	0
Heerenveen	5	4	1	2	1	2	2	0
CSKA Moscú	4	4	1	1	2	3	4	-1
Dinamo Bucarest	4	4	1	1	2	2	3	-1

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Rapid Bucarest	9	4	3	0	1	5	2	+3
Shakhtar Donetsk	9	4	3	0	1	4	1	+3
VfB Stuttgart	9	4	3	0	1	6	4	+2
PAOK Salónica	3	4	1	0	3	6	5	+1
Stade Rennais	0	4	0	0	4	1	10	-9

Equipo	Pts	PJ	PG	PE	PP	GF	GC	DG
Sevilla	7	4	2	1	1	8	4	+4
Zenit San Petersburgo	7	4	2	1	1	5	4	+1
Bolton Wanderers	6	4	1	3	0	4	3	+1
Beşiktaş	5	4	1	2	1	5	6	-1
Vitória Guimarães	1	4	0	1	3	4	9	-5

Equipo Local Ida	Resultado	Equipo Visitante Ida	Ida	Vuelta
Hertha Berlín	0:3	Rapid Bucarest	0:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
FC Thun	1:2	Hamburgo SV	1:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
SC Heerenveen	2:3	Steaua Bucarest	1:3 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	1:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Real Betis	3:2	AZ Alkmaar	2:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	(pró.)1:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
FC Basel	2:1	Mónaco	1:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	1:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Litex Lovech	0:2	Racing Estrasburgo	0:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
VfB Stuttgart	2:2 (v.)	Middlesbrough	1:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	1:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Club Brujas	2:4	Roma	1:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	1:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Udinese	3:1	Lens	3:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
FC Artmedia Bratislava	0:3	Levski Sofia	0:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Slavia Praga	2:2 (v.)	Palermo	2:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Schalke 04	5:1	Espanyol	2:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	3:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Lille	3:2	Shakhtar Donetsk	3:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Lokomotiv Moscú	0:3	Sevilla	0:1 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	0:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Bolton Wanderers	1:2	Olympique de Marsella	0:0 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	1:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
Rosenborg BK	1:4	Zenit San Petersburgo	0:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.	1:2 Archivado el 18 de mayo de 2008 en Wayback Machine.

	Dieciseisavos de final						Octavos de final						Cuartos de final						Semifinales						Final
	15 de febrero de 2006 (ida) 23 de febrero de 2006 (vuelta)						9 de marzo de 2006 (ida) 15 y 16 de marzo de 2006 (vuelta)						30 de marzo de 2006 (ida) 6 de abril de 2006 (vuelta)						20 de abril de 2006 (ida) 27 de abril de 2006 (vuelta)						10 de mayo de 2006 Philips Stadion, Eindhoven
	Hertha de Berlín	0	0	0
	Rapid de Bucarest	1	2	3
							Rapid de Bucarest (v.)	2	1	3
							Hamburgo	0	3	3
	Thun	1	0	1
	Hamburgo	0	2	2
													Rapid de Bucarest	1	0	1
													Steaua de Bucarest (v.)	1	0	1
	Heerenveen	1	1	2
	Steaua de Bucarest	3	0	3
							Steaua de Bucarest	0	3	3
							Real Betis	0	0	0
	Real Betis (t. s.)	2	1	3
	AZ Alkmaar	0	2	2
																			Steaua de Bucarest	1	2	3
																			Middlesbrough	0	4	4
	Basilea	1	1	2
	Mónaco	0	1	1
							Basilea	2	2	4
							Racing de Estrasburgo	0	2	2
	Litex Lovech	0	0	0
	Racing de Estrasburgo	2	0	2
													Basilea	2	1	3
													Middlesbrough	0	4	4
	Stuttgart	1	1	2
	Middlesbrough (v.)	2	0	2
							Middlesbrough (v.)	1	1	2
							Roma	0	2	2
	Brujas	1	1	2
	Roma	2	2	4
																									Middlesbrough	0
																									Sevilla	4
	Udinese	3	0	3
	Lens	0	1	1
							Udinese	0	1	1
							Levski Sofía	0	2	2
	Artmedia Bratislava	0	0	0
	Levski Sofía	1	2	3
													Levski Sofía	1	1	2
													Schalke 04	3	1	4
	Slavia Praga	2	0	2
	Palermo (v.)	1	1	2
							Palermo	1	0	1
							Schalke 04	0	3	3
	Schalke 04	2	3	5
	Espanyol	1	0	1
																			Schalke 04	0	0	0
																			Sevilla (t. s.)	0	1	1
	Lille	3	0	3
	Shakhtar Donetsk	2	0	2
							Lille	1	0	1
							Sevilla	0	2	2
	Lokomotiv Moscú	0	0	0
	Sevilla	1	2	3
													Sevilla	4	1	5
													Zenit	1	1	2
	Bolton Wanderers	0	1	1
	Olympique de Marsella	0	2	2
							Olympique de Marsella	0	1	1
							Zenit	1	1	2
	Rosenborg	0	1	1
	Zenit	2	2	4

Las eliminatorias de octavos de final quedaron decididas en el mismo sorteo de los dieciseisavos de final. La ida de esta eliminatoria se disputó el 9 de marzo de 2006, mientras que la vuelta el 15 y 16 de marzo.

9 de marzo de 2006	Rapid Bucarest	2:0 (1:0)	Hamburgo SV	Estadio Giuleşti, Bucarest
	Niculae  45+2' Buga  88'			Árbitro: Kyros Vassaras (Grecia)

15 de marzo de 2006	Hamburgo SV	3:1 (2:0)	Rapid Bucarest	Hamburgo Arena, Hamburgo
	Lauth  24' Barbarez  36' van der Vaart  62'		Buga  51'	Árbitro: Claus Bo Larsen (Dinamarca)

8 de marzo de 2006	Middlesbrough FC	1:0 (1:0)	AS Roma	Estadio de Riverside, Middlesbrough
	Yakubu  12' (p)			Árbitro: Alain Sars (Francia)

15 de marzo de 2006	AS Roma	2:1 (2:1)	Middlesbrough FC	Estadio Olímpico, Roma
	Mancini  43'  66' (p)		Hasselbaink  32'	Árbitro: Tom Henning Øvrebø (Noruega)

9 de marzo de 2006	Lille OSC	1:0 (1:0)	Sevilla FC	Estadio Lille Metropole, Villeneuve-d'Ascq
	Dernis  24'			Árbitro: Wolfgang Stark (Alemania)

15 de marzo de 2006	Sevilla FC	2:0 (2:0)	Lille OSC	Estadio Ramón Sánchez Pizjuán, Sevilla
	Kanouté  29' Luís Fabiano  45+2'			Árbitro: Michael Riley (Inglaterra)

9 de marzo de 2006	FC Basel	2:0 (1:0)	RC Estrasburgo	St. Jakob Park, Basilea
	Delgado  8' Kuzmanović  89'			Árbitro: Stefano Farina (Italia)

16 de marzo de 2006	RC Estrasburgo	2:2 (1:2)	FC Basel	Stade de la Meinau, Estrasburgo
	Carlier  11' Kanté  78'		Eduardo  3'  26'	Árbitro: Olegário Benquerença (Portugal)

16 de marzo de 2006	Real Betis	0:3 (0:0)	Steaua Bucarest	Estadio Manuel Ruiz de Lopera, Sevilla
			Nicoliţă  54'  82' Iacob  78'	Árbitro: Massimo De Santis (Italia)

9 de marzo de 2006	US Palermo	1:0 (1:0)	FC Schalke 04	Estadio Renzo Barbera, Palermo
	Brienza  15'			Árbitro: Eric Braamhaar (Países Bajos)

16 de marzo de 2006	FC Schalke 04	3:0 (1:0)	US Palermo	Arena AufSchalke, Gelsenkirchen
	Kobiashvili  44' (p) Larsen  72' Azaouagh  80'			Árbitro: Graham Poll (Inglaterra)

9 de marzo de 2006	Olympique Marsella	0:1 (0:0)	Zenit San Petersburgo	Stade Vélodrome, Marsella
			Arshavin  51'	Árbitro: Luis Medina Cantalejo (España)

16 de marzo de 2006	Zenit San Petersburgo	1:1 (0:0)	Olympique Marsella	Estadio Petrovsky, San Petersburgo
	Kerzhakov  69'		Déhu  74'	Árbitro: Herbert Fandel (Alemania)

16 de marzo de 2006	Levski Sofia	2:1 (0:1)	Udinese Calcio	Estadio Nacional Vasil Levski, Sofía
	Borimirov  51' Tomašić  63'		Tissone  22'	Árbitro: Steve Bennett (Inglaterra)

La ida de esta eliminatoria se disputó el 30 de marzo de 2006, mientras que la vuelta se jugó el 6 de abril.

30 de marzo de 2006	Sevilla FC	4:1 (1:1)	Zenit San Petersburgo	Estadio Ramón Sánchez Pizjuán, Sevilla
	Saviola  14'  80' (p) Martí  56' (p) Adriano Correia  90+3'		Kerzhakov  45'	Árbitro: Alain Hamer (Luxemburgo)

6 de abril de 2006	Zenit San Petersburgo	1:1 (0:0)	Sevilla FC	Estadio Petrovsky, San Petersburgo
	Hyun  50'		Kepa  66'	Árbitro: Stefano Farina (Italia)

30 de marzo de 2006	FC Basel	2:0 (2:0)	Middlesbrough FC	St. Jakob Park, Basilea
	Delgado  43' David Degen  45+1'			Árbitro: Roberto Rosetti (Italia)

6 de abril de 2006	Middlesbrough FC	4:1 (1:1)	FC Basel	Estadio de Riverside, Middlesbrough
	Viduka  33'  57' Hasselbaink  79' Maccarone  90'		Eduardo  23'	Árbitro: Iouri Baskakov (Rusia)