La evolución dirigida es un planteamiento técnico de la biotecnología que busca la generación y selección de variantes de proteínas de interés industrial. Para ello, emplea un enfoque de obtención artificial de dichas variantes basado en los mecanismos evolutivos de selección los clones de más interés.

Para ello, se efectúa un protocolo que conceptualmente posee tres pasos:

1. El fomento de la variabilidad en el ácido nucleico codificante de la proteína de interés mediante mutagénesis o recombinación al azar. Las técnicas usuales son la PCR en condiciones de baja astringencia (es decir, proclive a error) y el Barajado de ADN (en inglés, DNA shuffling).
2. Evaluación de las variantes mutantes de mayor interés y posterior selección. Por ejemplo, mediante ensayos bioquímicos de afinidad con un ligando.
3. Amplificación de los mutantes de interés. Puesto que la evolución dirigida suele realizarse a gran escala y la generación de variantes a gran escala, es preciso determinar el fundamento molecular de la característica de interés; es decir, clonar y secuenciar el ADN de los mutantes seleccionados.

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• Besenmatter, W.; Kast P. and Hilvert D. (2004). «New Enzymes from Combinatorial Library Modules». Methods in Enzymology 388: 91-102. doi:10.1016/S0076-6879(04)88009-1.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
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• Stemmer, W. P. (1994). «Rapid evolution of a protein in vitro by DNA shuffling». Nature 370 (6488): 389-391. ISSN 0028-0836. PMID 8047147. doi:10.1038/370389a0. 
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