Isidoro de Mileto el Joven o simplemente Isidoro el Joven (c.510–563) fue un arquitecto bizantino y sobrino del arquitecto Isidoro de Mileto.^[1]​ Al igual que su tío, era natural de Mileto.^[2]​

Según la obra Sobre los edificios de Procopio, Isidoro colaboró en sus inicios con otro joven arquitecto, Juan de Constantinopla, en las fortificaciones de Halabiye.^[1]​^[3]​^[4]​ Este trabajo, realizado durante el reinado de Justiniano I, incluía la construcción de iglesias, cuarteles y baños.^[1]​

En Qinnasrin una inscripción fechada en 550 y otra de la misma época mencionan a un arquitecto llamado Isidoro, y se asocia comúnmente con Isidoro el Joven.^[2]​^[3]​^[4]​ Las inscripciones, encontradas en dos casas, llaman a Isidoro mechanikos (μηχανικός) y vir illustris.^[1]​^[2]​

Según Procopio, cuando la cúpula de Santa Sophia diseñada por el anciano Isidoro se derrumbó tras un terremoto en 557, Isidoro el Joven supervisó su reparación;^[1]​^[3]​ este autor lo describe como el μηχανουργός (arquitecto).^[3]​ La nueva cúpula fue consagrada el 24 de diciembre de 562.^[2]​ Según Agatías, era menos imponente que la primera pero 6 metros más alta.^[1]​ La reconstrucción también se constata en los textos de Pablo Silenciario, Teófanes el Confesor y Juan Malalas.^[4]​ El trabajo de Isidoro muestra una precisión y calidad excepcionales si se compara con las restauraciones posteriores de la cúpula de los años 986-994 realizados por Trdat y de 1347-1354. En el actual edificio aún se conservan doce nervaduras de la restauración de Isidoro el Joven.^[3]​

Según Constantino de Rodas (c.siglo IX), Isidoro ayudó a diseñar la Iglesia de los Santos Apóstoles para Justiniano I.^[5]​

• Constantinus; James, Liz; Vassis, Ioannis (2012). Constantine of Rhodes, on Constantinople and the Church of the Holy Apostles. Farnham; Burlington: Ashgate. ISBN 9781409431671. OCLC 876679090. 
• Kourelis, Kostis (2008). «Isidōros the Younger (ca 510 – 563 CE)». En Paul T. Keyser; Georgia L. Irby-Massie, eds. The Encyclopedia of Ancient Natural Scientists: The Greek Tradition and Its Many Heirs. Routledge. 
• Loerke, William; Johnson, Mark J. (1991). «Isidore the Younger». En Alexander Kazhdan, ed. The Oxford Dictionary of Byzantium 2. Oxford; Nueva York: Oxford University Press. 
• Martindale, John R., ed. (1992). The prosopography of the later Roman empire 3. Cambridge: Cambridge Univ. Pr. ISBN 9780521201605. OCLC 311539193. 
• Rizos, Efthymios (2018). «Isidore of Miletus the Younger». En Nicholson, Oliver, ed. The Oxford Dictionary of Late Antiquity. 1: A–I. Oxford University Press. ISBN 9780198816249. OCLC 7352767000.