José Bonilla puede referirse a:
- José Bonilla (aviador), militar aviador uruguayo.
- José Bonilla (boxeador), boxeador venezolano.
- José Adrián Bonilla, ciclista costarricense.
- José Eulogio Bonilla, político mexicano.
- José Santiago de Bonilla y Laya-Bolívar, antiguo presidente de la Junta Superior Gubernativa de Costa Rica.
- Juan José de Bonilla y Herdocia, político de Costa Rica, firmante del Acta de Independencia de Costa Rica.