Su fundación se remonta a la repoblación efectuada por los reyes de León en la Edad Media, que la integraron en el cuarto de Baños de la jurisdicción de Salamanca, dentro del Reino de León, denominándose en el siglo XIIISanctivanes de Perales.[2]
El 24 de octubre de 1689 el rey Carlos II de España creó el Condado de Santibáñez del Río en referencia a esta localidad, otorgándoselo a Diego Godínez Brochero y Solís, título que sustituía al preexistente vizcondado de Santibáñez.
Iglesia románica de San Juan. Construida en el siglo XII,[4] destacan en ella la rosca del arco, imposta y parte superior del alfiz, decoradas con flores, entrelazos y cabezas de felinos, los canecillos sobre la portada y el alero, en que pueden observarse barriles, cabezas humanas, una gran serpiente, un jabalí o dos garzas bebiendo de la misma copa.