El sistema de Takhtajan es un sistema de clasificación de plantas publicado por Armen Takhtajan, en varias versiones a partir de los años 50. Usualmente se lo compara con el sistema de Cronquist, ambos admiten grupos parafiléticos. Publicaciones clave:

• A. Takhtajan (in Russian, 1966). A system and phylogeny of the flowering plants. 
• A. Takhtajan (1969, traducc. del ruso por C. Jeffrey). Flowering plants: origin and dispersal. 
• A. Takhtajan (1980). «Outline of the classification of flowering plants (Magnoliophyta)». Botanical Review 46: 225-359. doi:10.1007/BF02861558. 
• A. Takhtajan (2009). Flowering plants, 2nd ed. 

Publicado en Takhtajan, A. (1964). The taxa of the higher plants above the rank of order. Taxon 13(5): 160-164, [1]:

Subregnum Telomobionta (= Cormobionta)

• 1. Divisio Psilophyta

Classis Psilophytatae

• 2. Divisio Bryophyta

Classis Anthocerotatae

Classis Marchantiatae (Hepaticae)

Classis Bryatae (Musci)

• 3. Divisio Lycopodiophyta (= Lycophyta, Lepidophyta)

Classis Lycopodiatae

Classis Isoetatae

• 4. Divisio Psilotophyta

Classis Psilotatae

• 5. Divisio Equisetophyta (= Sphenophyta, Calamophyta)

Classis Hyeniatae

Classis Sphenophyllatae

Classis Equisetatae

• 6. Divisio Polypodiophyta (= Pteridophyta s.str., Pterophyta s.str.)

Classis Polypodiatae

• 7. Divisio Magnoliophyta (= Spermatophyta)

Subdivisio Lyginopteridicae (Pteridospermae)

Subdivisio Pinicae (Coniferophytina)

Classis Ginkgoatae

Classis Pinatae

Subdivisio Cycadicae (Cycadophytina)

Classis Cycadatae

Classis Bennettitatae

Subdivisio Gneticae (Chlamydospermae, Gnetophytina)

Subdivisio Magnolicae (Angiospermae)

Classis Magnoliatae (Dicotyledones)

Classis Liliatae (Monocotyledones)

• Clasificación de los organismos vegetales
• Clasificación filogenética APG

Sistema Takhtajan en CSDL, Texas Archivado el 2 de noviembre de 2008 en Wayback Machine.. Also at the Norton Brown Herbarium, Maryland (con una extensa lista de sinónimos, tanto nomenclaturales como taxonómicos, para cada nombre en el sistema): 1, 2, 3