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Se entiende por universidad autónoma a aquella que es independiente del control de otros entes, es decir, que no se necesita la aprobación de una autoridad gubernamental para aclarar o modificar las reglas internas de la institución. Este término puede estar vinculado o hacer referencia a los artículos de Wikipedia que se indican a continuación:
Bolivia
Chile
Colombia
- Universidad Autónoma de Bucaramanga
- Universidad Autónoma de Colombia
- Universidad Autónoma de Occidente
- Universidad Autónoma de Manizales
- Universidad Autónoma del Caribe
- Universidad Autónoma Latinoamericana
Costa Rica
- Instituto Tecnológico de Costa Rica (autónomo)
- Universidad de Costa Rica (autónoma)
- Universidad Estatal a Distancia (autónoma)
- Universidad Nacional de Costa Rica (autónoma)
- Universidad Técnica Nacional de Costa Rica (autónoma)
El Salvador
- Universidad Autónoma de El Salvador (nombre no oficial)
- Universidad Autónoma de Santa Ana
España
Guatemala
- Universidad de San Carlos de Guatemala (autónoma)
Honduras
México
Universidades Autónomas Nacionales: Universidad Nacional Autónoma de México
Universidades Autónomas Estatales:
- Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
- Instituto Tecnológico Autónomo de México
- Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro
- Universidad Autónoma Benito Juárez de Oaxaca
- Universidad Autónoma Chapingo
- Universidad Autónoma de Aguascalientes
- Universidad Autónoma de Baja California
- Universidad Autónoma de Baja California Sur
- Universidad Autónoma de Campeche
- Universidad Autónoma de Chiapas
- Universidad Autónoma de Chihuahua
- Universidad Autónoma de Ciudad Juárez
- Universidad Autónoma de Coahuila
- Universidad Autónoma de Durango
- Universidad Autónoma de Guadalajara
- Universidad Autónoma de Guerrero
- Universidad Autónoma de la Ciudad de México
- Universidad Autónoma de La Laguna
- Universidad Autónoma de Nayarit
- Universidad Autónoma de Nuevo León
- Universidad Autónoma de Occidente
- Universidad Autónoma de Querétaro
- Universidad Autónoma de San Luis Potosí
- Universidad Autónoma de Sinaloa
- Universidad Autónoma de Tamaulipas
- Universidad Autónoma de Tlaxcala
- Universidad Autónoma de Veracruz Villa Rica
- Universidad Autónoma de Yucatán
- Universidad Autónoma de Zacatecas
- Universidad Autónoma del Carmen
- Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo
- Universidad Autónoma del Estado de México
- Universidad Autónoma del Estado de Morelos
- Universidad Autónoma del Noreste
- Universidad Autónoma Indígena de México
- Universidad Autónoma Metropolitana
- Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
- Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo
- Universidad Popular Autónoma de Veracruz
- Universidad Popular Autónoma del Estado de Puebla
- Universidad Veracruzana
Nicaragua
Panamá
Paraguay
Perú
República Dominicana
Venezuela
- Universidad Central de Venezuela (autónoma)
- Universidad de Carabobo (autónoma)
- Universidad de los Andes (autónoma)
- Universidad de Oriente (autónoma)
- Universidad del Zulia (autónoma)