Después del fracaso del programa de tv de Rachel ella regresa a Ohio donde se entera de que sus padres se han divorciado y han puesto su casa en venta. Rachel se entera de que Sue ha eliminado todas las artes en McKinley y va en búsqueda del superintendente Bob Harris (Christopher Cousins) quien deja que el club glee regrese con la condición que Rachel lo lidere. Blaine está de regreso en Ohio liderando a Los Warblers ya que fue expulsado de NYADA, Will es el nuevo entrenador de Vocal Adrenaline, y Sam es el ayudante de la entrenadora Shannon Beaste. Kurt regresa a Ohio para ayudar a Rachel con New Directions como parte de su proyecto de tercer año en NYADA donde descubre que Blaine ahora está de novio con Dave Karofsky (Max Adler).

En la semana de bienvenida de viejos alumnos en McKinley, Rachel y Kurt siguen en búsqueda de nuevos miembros para New Directions por lo cual reciben la ayuda de Mercedes, Santana, Brittany Pierce, Artie, Tina, Quinn y Puck. En la academia Dalton, Blaine tiene un problema cuando la primera chica en asistir a la academia: Jane Hayward (Samantha Marie Ware), quiere formar parte Los Warblers pero que finalmente se traslada a McKinley para formar parte de New Directions luego que Los Warbers no la dejan formar parte del coro. Los antiguos miembros del coro logran reclutar a Roderick (Noah Guthrie) y a los gemelos Mason y Madison McCarthy (Billy Lewis Jr. y Laura Dreyfuss).

Kurt y Rachel planean su primera tarea para el nuevo New Directions, por lo cual deciden hacer una semana de mash-ups con temas del álbum de Carole King: Tapestry y de Alanis Morissette: Jagged Little Pill, pero ambos tienen problemas para tratar de comunicar la tarea a los miembros del coro. Santana decide llevar su relación con Brittany un paso más adelante pidiendo que se case con ella pero Kurt está en contra. Kurt cree que haber terminado su relación con Blaine fue lo mejor pero sus sentimientos hacia él aún son fuertes por lo cual esto complica su rol como profesor del coro. Mientras tanto, Quinn y Tina ayudan a Becky a impresionar a su nuevo novio diciendo que formaba parte del club glee y la entrenadora Beaste es diagnosticada con disforia de género y comenzará una operación de cambio de sexo con el apoyo de Sam y Sue.

Rachel le pide ayuda a Will y a Blaine para que tanto Vocal Adrenaline como Los Warblers se tomen a la ligera las "invitacionales" que Sue ha organizado en McKinley para no desilusionar a los chicos de New Directions. Sue se entera de que Will hará perder a su club glee por lo cual va con a directora Abigail Figgins Gunderson (Iqbal Theba) diciendo que Will no es leal a la preparatoria Carmel; Sue también hipnotiza a Sam con el fin de enamorar a Rachel y sacarla de la dirección de New Directions lo cual culmina con un beso entre ambos. Como parte de sus planes, Sue trata que Kurt retome su relación con Blaine comenzando a chantajear la relación de Blaine con Dave mientras que Kurt comienza a salir con Walter (Harry Hamlin), un hombre gay de 50 años. Vocal Adrenaline es el primer coro en presentarse en las invitacionales.

Luego de la presentación de Vocal Adrenaline en las invitacionales, Sue informa que las invitacionales durarán tres días, que New Directions será el último coro en presentarse y que la competencia seguirá adelante aunque uno de los entrenadores sea secuestrado en el proceso de la competencia, eso obliga a Rachel a traer de vuelta al coro a Kitty Wilde (Becca Tobin) quien ayuda a Rachel a escoger la lista perfecta para las invitacionales, canciones que afectan emocionalmente a Sue. Kurt y Blaine quedan encerrados en un falso ascensor construido por Sue donde no saldrán hasta que se besen. Sam logra reclutar a Spencer (Marshall Williams) para que se una al coro. Al momento de la presentación de New Directions en las invitacionales, mientras Kurt y Blaine quedan libres de la trampa de Sue luego de besarse, New Directions logra ganar las invitacionales.

Rachel y Sam siguen atrayéndose mutuamente mientras ella y Kurt asignan una tarea con la música de Burt Bacharach en el coro donde Mercedes regresa a Ohio para ser mentora de los nuevos chicos. Brittany les dice a sus padres: Whitney (Jennifer Coolidge) y Pierce (Ken Jeong) que se casará con Santana, y ellos a su vez le confiesan que su verdadero padre es Stephen Hawking. Mercedes, por una parte, le consigue a Rachel una audición para un nuevo musical en Broadway pero Rachel dice aún no estar lista para volver a los escenarios pero va de igual manera y por otra parte le dice a Sam que debe seguir a su corazón y comenzar a salir con Rachel. Mientras tanto, Artie se convierte en el planeador de la boda de Brittany y Santana y Brittany trata de reparar la relación rota entre Santana y su abuela, Alma Lopez (Ivonne Coll) pero sus planes no resultan como quiere. Los viejos y nuevos miembros de New Directions le dan su apoyo a Santana quienes estarán presentes el día de su boda.

Canciones interpretadas: «I'll Never Fall In Love Again» (Promises, Promises) por Rachel & Sam; «Baby It's You» (The Shirelles) por Mercedes; «Wishin' And Hoping» (Dionne Warwick) por Brittany, Artie, Blaine & Sam; «Arthur's Theme» (Christopher Cross) por Artie, Blaine, Mason, Roderick, Sam & Spencer; «Promises, Promises» (Promises, Promises) por Rachel; «They Long to Be Close to You» (Richard Chamberlain) por Sam; «Alfie» (Cilla Black) por Santana; «What the World Needs Now» (Jackie DeShannon) por Artie, Blaine, Kurt, Mercedes, Rachel, Sam & Will.

Will disfruta todos los lujos y comodidades que lleva ser el entrenador de Vocal Adrenaline pero extraña la compañía que New Directions entregaba y luego de enterarse de que Clint (Max George) y el resto de su equipo le lanzaran huevos a Rachel y Blaine decide enseñarles sobre la tolerancia con la ayuda de Wade "Unique" Adams (Alex Newell) pero a los miembros de su coro parece no importarles el tema. La entrenadora Shannon Beaste regresa a McKinley convertida en Sheldon Beaste y también es víctima de las bromas de Vocal Adrenaline. Por otra parte Sam, con la ayuda de Kurt, Blaine, Artie, Mercedes y Kitty planean una fiesta de despedida en la casa de infancia de Rachel, (la cual ya logró ser vendida) con todos los miembros de New Directions. En la fiesta, luego de que Blaine cantara un dueto con Kurt este besa a su ex-prometido sin razón alguna. Will por su parte sigue los consejos de su esposa Emma (Jayma Mays) y decide darles una nueva lección de compañerismo a Vocal Adrenaline haciéndoles creer que harán una nueva broma a los chicos de New Directions. Blaine termina su relación con Dave y va en búsqueda de Kurt pero no logra confesarle su amor ya que esta va a una cita doble con Walter, Rachel y Sam. Unique ayuda a Sheldon con el proceso de transición que está sufriendo cantando sobre el escenario junto a un coro de 300 personas transgénero; Will renuncia a ser el entrenador de Vocal Adrenaline y se convierte en el consultor oficial de New Directions.

Brittany y Santana deciden casarse en el mismo granero que Brittany nació como sugerencia de Whitney Pierce. Brittany hace que Burt Hummel (Mike O'Malley) oficie la ceremonia mientras que Santana no quiere que Sue esté presente en la boda. El día de la boda Sue llega al granero con Alma Lopez quien da su bendición a la pareja antes de la boda. Sue y Brittany convencen a Kurt y Blaine a casarse ese mismo día a lo cual la pareja accede. Por otra parte, Tina quiere proponerle matrimonio a Mike Chang (Harry Shum, Jr.) pero este declina sobre la proposición aunque acepta que la ama por lo cual Artie y ella prometen casarse a los 30 años si todavía se encuentran solteros. Finamente Sue le regala un viaje de luna de miel tanto a Brittany con Santana como a Blaine con Kurt.

Con la esperanza de obtener el premio al director del año, Sue le pide al Superintendente Bob Harris firme una carta de recomendación que ella misma escribió, a cambio él le pide que ayude a su sobrino: Myron Muskovitz (J.J. Totah) para planificar un show en su bar mitzvah por lo cual Sue va por la ayuda de New Directions. Mason tiene sentimientos encontrados hacia Jane pero cuando trata de concretar una cita con ella, Madison interrumpe en su camino creando un conflicto entre ambos. Por su parte Spencer se enamora del amigo de Roderick, Alistair (Finneas O'Connell), y este a su vez ayuda a Roderick a mejorar su estado físico. Madison y Mason se reconcilian aunque esta última no cambia su opinión sobre Jane mientras que Myron, con la ayuda de su tío, y Alistair, por el consejo de Spencer, terminan uniéndose al club glee completando así 8 miembros.

Después que la Academia Dalton se quemara completamente, parte de los miembros de Los Warblers se unen a New Directions para formar un nuevo equipo lo cual genera conflicto entre ambos coros. Sue trata de imponer su poder como directora en McKinley prohibiendo que los miembros de Los Warblers se unan al club glee lo cual desata la ira de Becky, poniendo fin a su amistad con Sue. Becky revela todos los secretos de Sue haciendo que el Superintendente Harris vea el casillero de castigo de Sue (Hurt Locker). Sue termina siendo despedida de McKinley y luego es entrevistada por Geraldo Rivera para FOX News donde se descubre que Sue es una mentirosa compulsiva. Entre las mentiras se encuentra que Michael Bolton no es el padre de su hija y que sus padres jamás fueron cazadores de nazis; en la entrevista, solamente Will y Sheldon Beaste defienden a Sue. La madre de Sue, Dorys Sylvester (Carol Burnett) la visita y tratan de arreglar su situación madre-hija. Sue se convierte en la nueva entrenadora de Vocal Adrenaline con el fin de acabar nuevamente con New Directions quienes, si no logran ganar las Locales, serán disueltos y el club será cancelado nuevamente. Por su parte Rachel viaja a Nueva York para pedirle a Carmen Tibideaux que la reinstale en NYADA. Al mismo tiempo Rachel consigue el papel en el nuevo musical donde Mercedes le había planeado una audición. Sam se preocupa que Rachel esté tomando el camino equivocado dejando de lado NYADA y concentrarse nuevamente en Broadway.

Mientras el coro se prepara para las Locales, Rachel recibe una visita sorpresa de Jesse St. James (Jonathan Groff) quien le dice a Rachel que ha sido elegido como el protagonista masculino en el musical que ella audicionó semanas atrás. Rachel aún no sabe si volver a la universidad o volver a Broadway. Mientras tanto, Roderick y Spencer van por la ayuda de Kitty para mejorar sus pasos de baile lo que termina con una torcedura en el tobillo de Spencer. Antes del día de la competencia, Sua ataca con bombas de brillo a New Directions, contamina el agua de McKinley e incendia el auto de Will en forma de venganza. Will, por su parte toma revancha rapando el cabello de Sue. En las Locales, Vocal Adrenaline hace una presentación que preocupa y asombra a los chicos de New Directions pero estos últimos resultan ser los ganadores. Luego de la competencia, Sue le dice a Will que saboteó internamente a Vocal Adrenaline y ayudó a New Directions para estar alertas en la competencia. Por otra parte, Rachel le dice a Jesse que volverá a NYADA, él queda conforme y se besan. El coro celebra su victoria en las Locales y Kitty propone traer de vuelta todos los trofeos que New Directions ha ganado a lo largo de su historia.

El episodio es un flashback del episodio piloto de la serie en 2009 donde muestras por qué los 5 miembros originales del coro se unieron a él. Kurt se encuentra deprimido y sin amigos donde cree que si desaparece nadie notará la diferencia, por ello Emma se pone en contacto con Burt para informarle esta situación. Burt le ordena a Kurt que tiene que unirse a un equipo dentro de McKinley por su propio bien, Kurt se hace amigo de Rachel y de Mercedes quienes lo ayudan para animarse a audicionar para el coro y a elegir la canción que presentar respectivamente. Rachel trata de conocer un poco más a Mercedes dado que es su competencia directa en el coro, lo cual las convierte en rivales. Artie y Tina audicionan para el coro como un desafío por parte de sus amigos. La relación de Sue y de Will es perfecta hasta que este no quiere renunciar a la dirección del club glee. Terri (Jessalyn Gilsig) le dice a Will que está embarazada por lo cual debe encontrar un nuevo empleo para sustentar a su familia. Los 5 miembros de New Directions discuten sobre dejar entrar a Finn Hudson (Cory Monteith) al coro donde todos acuerdan que él es como todos ellos. El episodio termina con la presentación de "Don't Stop Believin'" presentada en el capítulo piloto de la serie.

Luego de que New Directions ganara las Nacionales 2015, el superintendente Bob Harris decide transformar la secundaria McKinley en una escuela de artes con Will como director. Tres meses después Will anuncia que traerá de vuelta a las Troubletones y un coro de chicos llamada los Duly Noted. Blaine trata de convencer a Sam de volver a Nueva York con todos los graduados pero él se convierte en el nuevo director de New Directions. Mercedes anuncia que fue elegida como la telonera de la nueva gira mundial de Beyoncé por lo cual no verá a sus amigos en un largo tiempo. Kurt y Blaine agradecen a Sue por volver a unirlos, esta a su vez se reconcilia con Becky y acepta su derrota frente a Will. En 2020 Sue se transforma en la vicepresidenta de los Estados Unidos de América; Kurt y Blaine son actores de teatro que van dando mensajes de igualdad en distintas escuelas infantiles; Artie y Tina terminan siendo pareja nuevamente; Rachel es el vientre de alquiler de la hija de Kurt y Blaine y está casada con Jesse. Rachel gana un premio Tony el cual le agradece a Will. En otoño de 2020, Sue da a conocer que las escuelas de artes basadas en McKinley fueron replicadas a lo largo del país y renombra el auditorio de McKinley como el "Auditorio Finn Hudson". Al final Will junto a la mayoría de todos los miembros que pasaron por New Directions cantan sobre el escenario por última vez.